6 grudnia 2024 na łamach czasopisma ACS „The Journal of Organic Chemistry” ukazała się praca naukowców z naszego Wydziału : dr Joanny Nowak-Karnowskiej, dr Katarzyny Taras-Goślińskiej i Prof. UAM dr. hab. Bohdana Skalskiego pt. „Intrastrand Photo-Crosslinking of 5-Fluoro-2′-O-methyl-4-thiouridine-Modified Oligonucleotides and Its Implication for Fluorescence-Based Detection of DNA Sequences” (J. Org. Chem. 2024, 89, 23, 17155–17162).
Graficzna prezentacja artykułu została wyróżniona okładką czasopisma, która ilustruje reakcję fotozszywania w DNA z udziałem 5-fluoro-4-tiourydyny i powstawanie międzyniciowego produktu fotozszywania o właściwościach fluorescencyjnych (https://pubs.acs.org/toc/joceah/89/23).
W artykule przedstawiono zastosowanie sondy oligonukleotydowej zawierającej 5-fluoro-2′-O-metylo-4-tiourydynę (FSU) do fluorescencyjnego wykrywania specyficznych sekwencji DNA. Wyniki badań wskazują, że FSU może reagować z odległymi zasadami; w szczególności może reagować z tyminą i cytozyną, tworząc odpowiednio fluoryzujące i niefluoryzujące wewnątrzniciowe produkty fotozszywania. Wyniki badań mają istotne znaczenie w kontekście wykorzystania sond oligonukleotydowych znakowanych FSU w wykrywaniu specyficznych sekwencji DNA, ponieważ tworzenie fluoryzującego wewnątrzniciowego produktu fotozszywania może prowadzić do powstania fałszywego sygnału. Aby rozwiązać ten problem, zaproponowano i przetestowano zastąpienie tymidyny w sondzie oligonukleotydowej znakowanej FSU deoksyurydyną.
